Apa itu Kode genetik

Kode genetik adalah seperangkat aturan yang menentukan bagaimana urutan nukleotida dalam mRNA diterjemahkan menjadi urutan asam amino dalam protein. Kode ini bersifat universal dan ditemukan di semua organisme hidup (dengan sedikit pengecualian). Informasi genetik untuk perakitan asam amino disimpan dalam urutan kecil tiga nukleotida yang disebut kodon dalam mRNA.

Setiap kodon mewakili satu dari dua puluh asam amino yang digunakan dalam pembuatan protein. Kode direpresentasikan dalam tabel yang mengidentifikasi asam amino yang dikodekan oleh setiap kodon. Jumlah kodon yang mungkin adalah 64, dimana 61 asam amino menyandikan (salah satunya juga kodon start, AUG) dan tiga sisanya adalah situs berhenti (UAA, UAG, UGA).

Selain 20 asam amino klasik ini, ada dua lainnya yang penemuannya relatif baru: selenocysteine ​​(Sec, U) dan pyrrolysine (Pyl, O). Dalam kedua kasus, keduanya dikodekan oleh kodon yang biasanya merupakan penyelesaian translasi: masing-masing UGA dan UAG.

Asam amino yang tidak dapat disintesis oleh tubuh dan harus digabungkan dengan makanan disebut esensial. Sebaliknya, asam amino yang mampu disintesis oleh tubuh sendiri disebut non-esensial.

Esensial:

  • Valine (Val, V)
  • Leusin (Leu, L)
  • Treonina (Thr, T)
  • Lisin (Lys, K)
  • Triptofan (Trp, W)
  • Histidin (His, H)
  • Fenilalanin (Phe, F)
  • Isoleusin (Ile, I)
  • Arginine (Arg, R)
  • Metionin (Bertemu, M)

NonEsensia:

  • Alanin (Ala, A)
  • Prolin (Pro, P)
  • Glisin (Gly, G)
  • Serine (Ser, S)
  • Sistein (Cys, C)
  • Asparagine (Asn, N)
  • Glutamin (Gln, Q)
  • Tirosin (Tyr, Y)
  • Asam aspartat (Asp, D)
  • Asam glutamat (Glu, E)

* Klasifikasi dapat berbeda menurut spesies.

Kode genetik bersifat degenerasi, yang berarti bahwa terdapat lebih dari satu kodon yang mengkode asam amino yang sama. Sebagian besar degenerasi ini disebabkan oleh variasi nukleotida ketiga kodon. Dari 20 asam amino klasik, hanya dua (metionin dan triptofan) yang dikodekan oleh satu kodon. Sebaliknya, tiga asam amino (leusin, serin, dan arginin) masing-masing dikodekan oleh enam kodon. Kodon berbeda yang mengkode asam amino yang sama disebut kodon sinonim.

Keberadaan kodon sinonim memungkinkan mutasi titik tertentu (mutasi diam) tidak memiliki konsekuensi bagi organisme, dengan memengaruhi nukleotida kodon sinonim yang tidak cocok. Misalnya, jika kodon GCA muncul dalam urutan mRNA, mutasi nukleotida ketiga (A) ke yang lain (G, U, C), bahkan jika itu secara permanen mengubah urutan keturunan (gen) tidak akan memiliki konsekuensi, mengingat bahwa kodon baru akan terus mengkode asam amino (alanin) yang sama dan protein akhir tidak akan diubah.

Tabel terbalik dari kode genetik